北京大学物理学科的本科教育始于1913年，当时北京大学设立了“物理学门”。这标志着我国近代物理本科教育的开端。此后，该机构于1919年更名为“物理系”。

“物理学门”是北京大学在民国初期采用的一种学科建制名称，类似于今天的“专业”。1919年，北京大学进行学制改革，将“门”改为“系”，因而更名为“物理系”。它的建立是中国高等教育现代化的重要里程碑。在百余年的发展中，该机构汇聚并培养了无数中国物理学界的精英，参与了新中国首个核科学、半导体物理等多个关键领域的创建工作。2001年，在原物理系等多个单位基础上，扩建为如今的“北京大学物理学院”。